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中国医学科学院医学实验动物研究所DNA(羟)甲基化测序采购项目比价采购公告

2024年02月28日 来源:

中国医学科学院医学实验动物研究所DNA(羟)甲基化测序采购项目进行比价采购诚邀具备相应资质的供应商前来参加。

一、项目名称:中国医学科学院医学实验动物研究所DNA(羟)甲基化测序采购

二、预算金额:13.05万元

三、采购内容:DNA(羟)甲基化测序

四、采购品目:服务

五、采购需求概括:

本采购项目打算开展9个大鼠大脑皮层组织标本的全基因组DNA精准甲基化5mC和羟甲基化5hmC测序分析,应具有开展基因组DNA甲基化和羟甲基化相关服务和资质。方案如下:基因组DNA打断后,加入C、5mC、5hmC和5fC等不同修饰的spike-in control,基于oxBS氧化亚硫酸盐处理,通过Illumina Novaseq测序,完成组织标本全基因组DNA甲基化和羟甲基化测序分析。

分析内容包括:

  1. 测序数据质控比对,转化效率及覆盖率评估;
  2. 全基因组甲基化/羟甲基化水平概览① 基于样本包括:样本全基因组甲基化/羟甲基化图谱甲基化/羟甲基化平均水平统计/全基因组甲基化/羟甲基化的分布/ 各样本甲基化/羟甲基化水平分布比较/各基因元件的甲基化/羟甲基化水平特征/单样本甲基化//羟甲基化Circos图/基于全基因组甲基化/羟甲基化图谱的相关性分析。②基于样本分组包括:组全基因组甲基化/羟甲基化图谱/甲基化/羟甲基化平均水平统计/全基因组甲基化/羟甲基化的分布/各组甲基化/羟甲基化水平分布比较/各基因元件甲基化/羟甲基化水平特征/分组Circos图/基于全基因组甲基化/羟甲基化图谱的相关性分析/基于全基因组甲基化/羟甲基化图谱的分层聚类/基于全基因组甲基化/羟甲基化图谱的PCA分析。
  3. 差异甲基化/羟甲基化位点(DMC/hDMC)的鉴定及统计差异甲基化/羟甲基化位点(DMC/hDMC)的鉴定/(DMC/hDMC)的注释/(DMC/hDMC)修饰基因的统计/(DMC/hDMC)在染色体上的分布/(DMC/hDMC)在基因元件上的分布/(DMC/hDMC)修饰基因的功能富集分析
  4. 差异甲基化/羟基化区域的鉴定及统计:差异甲基化/羟甲基化区域(DMR/hDMR)的鉴定/(DMR/hDMR)的注释/(DMR/hDMR)修饰基因的统计/(DMR/hDMR)在染色体上的分布/(DMR/hDMR)在基因元件上的分布/(DMR/hDMR)修饰基因的功能富集分析
  5. 服务周期:35个自然日。

六、预计采购时间:2024年3月

七、合格供应商的资格要求:

(一)具有独立承担民事责任的能力;具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;法律、行政法规规定的其他条件;

(二)供应商必须是在中华人民共和国境内注册,具有独立法人资格的单位或其他组织;

(三)如国家对本项目相关专业有特别规定或资质要求,则必须符合相关规定或具有相关资。

八、比价响应:

(一)送达时间:请于2024年3月6日之前

(二)方式:发送至后勤管理办公室邮箱houqin@cnilas.org

(三)报价文件请按送达时间要求由本项目授权代表准时送达,请递交相关人员联系方式,产品报价、服务设计方案、组织机构代码证、企业税务登记证、近三年内同类项目合同(3份以上)复印件、无条件接受违法违规行为公示承诺书、本公司营业执照、资质及相关证件,并填写《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》。

(四)提早、逾期收到或不符合规定的比价响应文件恕不接受。

(五)缺少相关文件或缺少《采购供应商廉洁承诺书(动研所)》不予采纳。

九、相关单位信息:

采购单位:中国医学科学院医学实验动物研究所

   址:北京市朝阳区潘家园南里5号

人:麻老师

联系电话:010-67776051

 

 

附件:采购供应商廉洁承诺书(动研所)